Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Knop1Q9Z2Q2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms