Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt16Q9Z2K1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms