Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mbd4Q9Z2D7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mbd4Q9Z2D7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms