Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tulp1Q9Z273 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms