Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip6Q9Z1Y4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms