Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T6

Pikfyve, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PikfyveQ9Z1T6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PikfyveQ9Z1T6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms