Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ap3b1Q9Z1T1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms