Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syngr4Q9Z1L2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms