Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sumo3Q9Z172 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms