Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Sh3bp5Q9Z131 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Sh3bp5Q9Z131 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Sh3bp5Q9Z131 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Sh3bp5Q9Z131 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp5Q9Z131 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Sh3bp5Q9Z131 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Sh3bp5Q9Z131 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Sh3bp5Q9Z131 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sh3bp5Q9Z131 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms