Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NgfrQ9Z0W1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms