Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AireQ9Z0E3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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AireQ9Z0E3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AireQ9Z0E3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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