Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn5Q9WVD4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms