Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme3Q9WV85 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms