Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lhx9Q9WUH2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lhx9Q9WUH2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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