Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13bQ9WU72 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13bQ9WU72 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13bQ9WU72 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13bQ9WU72 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfsf13bQ9WU72 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms