Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc2Q9R244 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms