Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sorbs3Q9R1Z8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms