Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmed2Q9R0Q3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms