Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrkQ9R0G8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrkQ9R0G8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms