Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lamc3Q9R0B6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lamc3Q9R0B6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lamc3Q9R0B6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms