Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Col4a3Q9QZS0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Col4a3Q9QZS0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Col4a3Q9QZS0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col4a3Q9QZS0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Col4a3Q9QZS0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col4a3Q9QZS0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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