Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afyQ9QZQ8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afyQ9QZQ8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms