Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Npas3Q9QZQ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Npas3Q9QZQ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms