Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp21Q9QZL6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp21Q9QZL6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms