Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phtf1Q9QZ09 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phtf1Q9QZ09 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms