Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Homer2Q9QWW1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Homer2Q9QWW1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms