Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rai2Q9QVY8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai2Q9QVY8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms