Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Higd1aQ9JLR9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Higd1aQ9JLR9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Higd1aQ9JLR9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms