Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tgm1Q9JLF6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tgm1Q9JLF6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms