Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot9Q9JKY0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms