Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pole3Q9JKP7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pole3Q9JKP7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pole3Q9JKP7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pole3Q9JKP7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pole3Q9JKP7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pole3Q9JKP7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms