Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
AtrQ9JKK8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
AtrQ9JKK8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms