Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp39a1Q9JKJ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms