Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms