Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smpd3Q9JJY3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smpd3Q9JJY3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms