Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpf2Q9JJ80 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms