Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmod3Q9JHJ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Tmod3Q9JHJ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tmod3Q9JHJ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tmod3Q9JHJ0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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