Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms