Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ropn1lQ9EQ00 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ropn1lQ9EQ00 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ropn1lQ9EQ00 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms