Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clstn1Q9EPL2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms