Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trmt112Q9DCG9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trmt112Q9DCG9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms