Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms