Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms