Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms