Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Swt1Q9DBQ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Swt1Q9DBQ9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms