Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrpraQ9DBG7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms