Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg7Q9D906 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms