Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot8Q9D8X5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms