Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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